Armia estońska kontynuuje modernizacje broni strzeleckiej. Dowództwo sił specjalnych ogłosiło, że w 2021 przezbroi podległych sobie żołnierzy. Na standardowy karabinek estońskich jednostek specjalnych wybrany został Heckler & Koch HK416 kal. 5,56 x 45 mm. Broń jest wyposażona w długą, zoptymalizowaną pod względem masy osłonę z szynami MIL-STD 1913 i interfejsami HKey. Ma dźwignię bezpieczeństwa z przełącznikiem 45 stopni, który można obsługiwać z obu stron. Standardowo jest w niej instalowany celownik Aimpoint Micro-T1. Do tej pory estońskie siły specjalne używały karabinków Heckler & Koch G36.
Estońskie siły specjalne mają również zostać wyposażone w nowy typ pistoletu. Jest nim Glock 19 kal. 9x19 mm. Kompaktowe pistolety tego typu są używane przez wiele jednostek specjalnych na całym świecie.
Armia estońska ogłosiła w ubiegłym roku, że rozpocznie wprowadzanie do uzbrojenia karabinka szturmowego R-20 Rahe – broni typu AR-15 kal. 5,56 mm x 45 mm produkowanej przez LMT Defense. Z kolei w marcu 2021 ma rozpocząć się proces wyboru nowego uniwersalnego karabinu maszynowego kal. 7,62x51 mm. Miałby być on dostarczany od 2022 w ramach 7-letniej umowy ramowej. Obecnie żołnierze estońscy używają dwóch typów uniwersalnych karabinów maszynowych: MG3, które otrzymały od armii niemieckiej, oraz MAG, wyprodukowanych przez FN Herstal jako Kulspruta Ksp58, które otrzymały jako pomoc wojskową od Szwecji.