16 czerwca 2023 Embraer dostarczył brazylijskim wojskom lotniczym (FAB) 6. wielozadaniowy samolot transportowy C-390. To pierwszy samolot tego typu w konfiguracji pełnej zdolności operacyjnej (FOC). Jego certyfikacja potwierdza, że spełnia on wszystkie wymagania FAB i może wykonywać wszystkie misje, do których został zaprojektowany. Samolot będzie obsługiwany przez First Troop Transport Group (1º GTT) FAB z bazy Anápolis w środkowo-wschodniej Brazylii.
Pozostałe, już dostarczone FAB, C-390 zostaną zmodyfikowane do konfiguracji FOC. Wszystkie eksportowane samoloty tego typu również mogą otrzymać taką możliwość. Dotyczy to 5 C-390 zamówionych przez Portugalię i 2 dla Węgier. W 2022 brazylijskie samoloty wybrała też Holandia, która zamierza zamówić 5 C-390.
Od wejścia do służby w FAB w 2019 flota C-390 wykonała już ponad 8900 godzin lotów. Według Embraera, ostatnie dane pokazują dostępność operacyjną C-390 na poziomie około 80%. Wskaźnik ukończenia misji jest zaś wyższy niż 99%.